Nad svim laboratorijskim pretragama, koje se rade referentnim ili standardnim metodama, provodi se kontrola kvalitete svakodnevno, dok izvanlaboratorijsku procjenu kvalitete provodi Povjerenstvo Hrvatskog društva medicinskih biokemičara (HDMB) i Deutsche Gesellschaft für Klinische Chemie und Laboratoriumsmedizin – Reference Institute for Bioanalytics of the German Society of Clinical Chemistry and Laboratory Medicine (DGKK-RfB), 3 -4 puta godišnje.